La coopération de proximité concerne les actions conduites avec des territoires proches les uns des autres dans l'espace.
 

Elle permet de tisser des liens et de développer des projets avec les territoires voisins. Ses objectifs sont de dynamiser les relations entre partenaires cantonaux et transfrontaliers des régions voisines, de mutualiser les compétences des différents acteurs concernés, de penser l'espace économique, social, géographique du Jura dans sa globalité et non limité par ses frontières.

Les projets développés dans ce cadre concernent des domaines variés (ex.: la culture, l'économie, les transports, etc.) et font appel aux compétences de tous les services administratifs de la République et canton du Jura.

La coopération de proximité concerne donc autant la coopération intercantonale que la coopération transfrontalière.