L'A16 Transjurane a été intégrée dans le réseau suisse des routes nationales en octobre 1984. La Section des constructions routières est chargée de la réalisation des 48 kilomètres de l'A16 dans le canton du Jura, de Boncourt à la Roche Saint-Jean.

D'une longueur totale de 85 kilomètres de Boncourt à Bienne, l'A16 présente s'inscrit dans le paysage de la région selon le tracé suivant: Boncourt - Bure - Porrentruy - Saint-Ursanne - Glovelier - Bassecourt - Delémont - Choindez - Moutier - Court - Loveresse - Tavannes - Sonceboz - La Heutte - Gorges du Taubenloch - Bienne Est (Champ de Boujean).

A ce jour (22.08.2014), il ne reste plus que deux tronçons à terminer: Delémont-Choindez (2016) dans le canton du Jura, COurt-Loveresse (également 2016) dans le canton de Berne. 

L'A16 est financée principalement par la Confédération, à raison de 95% dans le canton du Jura et 84% puis 87% dès 2005 dans le canton de Berne.

L'A16 étant une route nationale de 2e classe, les tunnels et tranchées couvertes d'une longueur supérieure à 1000 mètres sont réalisés à un seul tube de deux voies de circulation bidirectionnelles. Pour les tronçons à ciel ouvert, le profil en travers prévoit une chaussée à deux voies de circulation et des places d'arrêt d'urgence. Lorsque les conditions le permettent, le profil peut être porté à quatre voies de circulation avec des bandes de roulement séparées.

Lorsqu'elle sera complètement réalisée, de Boncourt à Bienne, la Transjurane placera notre région dans une situation centrale en matière de transports. L'accessibilité ainsi améliorée engendrera une augmentation de l'attractivité de toute la région jurassienne.

Les huit sections de l'A16 dans le canton du Jura
  Section L (km) Mise en service
1 Plate-forme douanière de Boncourt 0.2 17.12.2007
2a Boncourt–Bure 4.6 11.11.2011
2b Bure–Porrentruy Ouest 8.8 21.08.2014
3 Porrentruy Ouest–Porrentruy Est 2.9 30.09.2005
4 Porrentruy Est–Portail nord du tunnel du Mont-Terri 5.2 13.11.1998
5 Portail nord du tunnel du Mont-Terri–Portail sud du tunnel du Mont-Russelin 8.0 13.11.1998
6 Portail sud du tunnel du Mont-Russelin–Delémont Ouest 9.9 13.11.1998
7 Delémont Ouest–Delémont Est 3.2 30.09.2005
8 Delémont Est–Frontière cantonale Jura-Berne 4.7 Fin 2016