Le Tribunal cantonal est compétent dans les domaines civil, pénal et administratif. Il comprend sept sections. Deux de ses magistrats sont en outre présidents des Tribunaux arbitraux en matière d'assurance.
Principe: tous les juges, permanents et suppléants, sont attribués à toutes les sections, sous réserve des cas d'incompatibilité frappant les juges de première instance et les procureurs qui, en leur qualité de juges suppléants du TC, ne peuvent siéger qu'à la Cour administrative et à la Cour des assurances (art. 11 RTC et 7 al. 2 de la loi d'incompatibilité)
La Cour constitutionnelle
Elle contrôle, sur requête et avant mise en vigueur, la conformité des dispositions légales cantonales et communales au droit de rang supérieur. Elle est également compétente en matière de contentieux électoral, de conflit de compétences et de litiges relatifs à l'autonomie des collectivités publiques.
Présidente: Sylviane Liniger Odiet
Vice-président: Daniel Logos
La Cour pénale
Elle traite des appels formés contre les jugements rendus par le juge pénal, le Tribunal pénal et le Tribunal des mineurs ainsi que des demandes de révision. Elle statue à trois membres.
Président: Pascal Chappuis
Vice-président: Jean Crevoisier
La Cour civile
Elle traite des recours (appels et recours) contre les jugements du Tribunal de première instance (juge civil, Conseil de prud'hommes, Tribunal des baux à loyer et à ferme). En outre, dans certains cas, elle fonctionne comme juridiction cantonale unique.
Présidents: Daniel Logos et Nathalie Brahier
La Chambre pénale des recours
Elle traite des recours formés contre les actes de procédure et les décisions de la police, du Ministère public ainsi que du juge des mesures de contrainte. Elle est également compétente pour statuer sur les recours formés contre des décisions du juge pénal et du Tribunal pénal qui ne sont pas susceptibles d'appel. Elle statue à trois membres.
Président: Daniel Logos
Vice-présidente: Sylviane Liniger Odiet
La Cour administrative
Elle connaît des recours formés contre les jugements rendus par le juge administratif du Tribunal de première instance, la Commission cantonale de recours en matière d'impôts et contre les décisions rendues par la plupart des organes de l'administration cantonale. Elle statue également sur les recours contre des décisions rendues par l'Autorité de protection de l'adulte et de l'enfant.
Présidente: Sylviane Liniger Odiet
Vice-président: Daniel Logos
Présidents dans les affaires de protection de l'adulte et de l'enfant:
Jean Crevoisier, Sylviane Liniger Odiet et Nathalie Brahier
Président dans les affaires fiscales: Daniel Logos
La Cour des assurances
Elle connaît des contestations dans le domaine de la sécurité sociale (notamment en matière d'assurance-invalidité et d'assurance-accidents).
Président: Jean Crevoisier
Vice-président: Nathalie Brahier
Présidents en matière d'assurance-invalidité: Nathalie Brahier, Jean Crevoisier et Pascal Chappuis
Présidents en matière d'assurance-accident: Pascal Chappuis et Jean Crevoisier
Présidents en matière d'assurance-maladie: Pascal Chappuis et Jean Crevoisier
La Cour des poursuites et faillites
Elle fonctionne en qualité d'autorité cantonale de surveillance en matière de poursuites et faillites.
Président: Pascal Chappuis
Vice-président: Nathalie Brahier
Le Tribunal arbitral en matière d'assurance-accident
Il est compétent pour statuer sur les litiges entre assureurs et personnes exerçant une activité dans le domaine médical, dans des laboratoires, établissements hospitaliers et établissements de cure. Il se compose d'un président, juge au Tribunal cantonal, et de représentants de chaque partie. Il statue à trois membres.
Président: Jean Crevoisier
Vice-président: Pascal Chappuis
Représentants des professions médicales et paramédicales: Hervé Duplain et Laurence Riat; suppléants: Jean Gainon et Alain Lenglet
Représentants des assurances-accidents : Loïc Aubry et Fabrice Mouttet; suppléants: Michel Collin et Sébastien Froté
Le Tribunal arbitral en matière d'assurance-maladie
Il est compétent pour statuer sur les litiges entre les assureurs et les fournisseurs de prestations (notamment médecins) au sens de l'article 89 LAMal. Il se compose d'un président, juge au Tribunal cantonal, et d'un nombre égal de représentants des assureurs et des fournisseurs de prestations. Il statue à trois membres.
Président: Pascal Chappuis
Vice-président: Jean Crevoisier
Représentants des professions médicales et paramédicales: Hervé Duplain et Laurence Riat; suppléants: Jean Gainon et Alain Lenglet
Représentants des caisses-maladie: Marie-Luce Von Siebenthal et Jacques Moullet ; suppléants : Pierre Boinay et Michel Joray