Canton du Jura

Celui de l'Age du Bronze était accompagné de près de 900 tessons de poterie (dont certains décorés selon la technique de l'excision, typique de la fin du Bronze moyen ou du début du Bronze final), d'un fragment de meule, de quelques galets de quartzite ayant servi de percuteurs, d'une dalle calcaire rougie au feu et du seul fragment de métal retrouvé: un morceau de bracelet en bronze. La couche comprise entre ces deux derniers foyers, épaisse de 20 à 30 cm, comportait 2 artefacts lithiques, 2 poinçons en os et les fragments d'un crâne humain attribué à un individu de sexe masculin, âgé de 15 à 18 ans (peut-être les restes d'un corps incinéré).

La faune pléistocène est composée à plus de 90 % d'ours des cavernes (toutes les autres espèces n'étant représentées que par un petit nombre d'ossements). Cet animal est d'ailleurs l'auteur d'un lustrage des parois, provoqué par le frottement répété, appelé "poli d'ours". Cette faune comporte encore un ensemble d'espèces révélatrices d'un climat froid, telles que le lion des cavernes, le chamois, la marmotte, le bouquetin ou le campagnol des neiges. La faune holocène, à placer dans un contexte climatique plus clément, comprend entre autres: le cheval, le cerf, le sanglier, le chat ou le renard.

Cette grotte a livré une série de 7 pièces, fortement concassées sur leurs bords minces, attribuables au Moustérien; elle se compose de 6 éclats (en silex, chaille et lydienne) et d'un racloir en silex. Le 4 septembre 1955, à 2,9 m de profondeur, dans une sorte de niche naturelle, F.-E. Koby découvrit une incisive supérieure gauche de Néandertalien. Il s'agit d'un des deux plus anciens vestiges humains en Suisse.

Des traces de foyer et quelques silex en bon état, dont une pointe, peuvent être datés de l'Azilien. Le mobilier de l'Age du Bronze est constitué par une vingtaine de tessons de céramique appartenant à 2 pots.

La faune, avec beaucoup moins d'espèces représentées qu'à Saint-Brais I, est également divisible en 2 groupes. Le premier indique un climat froid avec, par exemple, le lemming à collier, le putois des steppes, le chocard à bec jaune et l'ours des cavernes, ce dernier à plus de 90 %. La datation carbone 14, sur la base d'ossements d'ours des cavernes, situe à au moins 30'000 ans av. J.-C. l'âge du niveau à ours. Le second suppose un climat plus clément, illustré par le renard, le cerf, le chevreuil, le mouton, le loir ou le bœuf domestique.

Koby observa, en profondeur, les traces d'un foyer paléolithique.
Un foyer stérile et 124 tessons de céramique de l'Age du Bronze ont également été découverts. La couche pléistocène à ours des cavernes est absente de cette grotte.

Les trois grottes de Saint-Brais ont servi d'habitat, ou pour le moins de refuge, au début de l'Age du Bronze final, vers 1200 av. J.-C. comme en témoignent les nombreuses poteries en terre cuite découvertes.

La grotte de Saint-Brais II fait partie d'un ensemble de trois grottes situées en pied de falaise à l'est de Saint-Brais. Lors de la dernière glaciation, l'extension maximale des glaciers a épargné le territoire cantonal, ce qui a permis la conservation ponctuelle de vestiges d'occupations humaines antérieures à la fin de cet événement. La grotte de Saint-Brais II est le plus célèbre de ces sites jurassiens. C'est en effet à cet emplacement qu'une incisive supérieure gauche de Néandertalien, datée d'environ 40'000 ans av. J.-C., a été retrouvée lors de fouilles menées dans les années 1950 par F.-E. Koby, ophtalmologue jurassien féru de spéléologie et d'archéologie. Il s'agit d'un des deux plus anciens restes humains de Suisse, remontant au Paléolithique moyen, le second étant représenté par un maxillaire supérieur retrouvé dans la grotte de Cotencher (canton de Neuchâtel). Le niveau moustérien dans lequel la dent a été retrouvée contenait également des ossements d'ours des cavernes, de même qu'une industrie peu abondante en silex et quartzite. L'importance du site étant démontrée, décision fut prise il y a une trentaine d'années de protéger la grotte à l'aide d'une grille cadenassée, ceci afin d'éviter des déprédations et ainsi de préserver les sédiments encore en place en vue d'y mener ultérieurement de nouvelles recherches.